Há mais de 130 projetos de pesquisa cadastrados na plataforma do CMABio, abrangem 21 Instituições públicas e privadas, 22 programas de pós-graduação e 6 estados brasileiros. Os estudos realizados no CMABio envolvem a caracterização de agentes etiológicos de doenças tropicais, caracterização morfológica de novas espécies de fungos e bactérias de interesse econômico e biotecnológico da fauna amazônica, avaliação da influência de mudanças climáticas sobre o processo evolutivo de espécies, estudo de materiais aplicados na área da saúde e indústria, caracterização de mudanças morfológicas ocasionadas pela COVID-19, bioprodução de materiais provenientes da flora amazônica, dentre outros.